O Projecto do século XIX

As obras mais profundas, com projecto do engenheiro e tenente-coronel Adolfo Loureiro, decorreram na segunda oficina em 1880. Consistiram na divisão da sala num laboratório ou sala das colecções, três gabinetes, arrecadações, corredor e escada de acesso a um amplo sotão criando um andar superior.

Todos os laboratórios foram dotados de mobiliário adequado, bancadas de química com lavatório no topo e estantes para reagentes. Foram construídas novas hottes ou nichos de evaporação, algumas aproveitando as antigas chaminés e anulando os fornos existentes. Os antigos gabinetes foram adaptados a três salas para análise de gases, análise orgânica e trabalhos com fogo e no vão da escada um gabinete de análise espectral. Na passagem do século o Laboratório encontrava-se modernizado seguindo os ideais do progresso técnico-científico na Europa.